HACCP不是一個單獨運作的系統。在美國的食品安全體系中，HACCP是建立在GMPs和SSOPs基礎之上的，并與之構成一個完備的食品安全體系。

HACCP更重視食品企業經營活動的各個環節的分析和控制，使之與食品安全相關聯。例如從經營活動之初的原料采購、運輸到原料產品的儲藏，到生產加工與返工和再加工、包裝、倉庫儲放，到

危害分析與關鍵點控制，涉及到的企業生產活動的各個方面，如采購與銷售、倉儲運輸、生產、質量檢驗等等，為的是在經營活動可能產生的各個環節保障食品的安全。另外HACCP還要求企業有一套召回機制，由企業的管理層組成一個小組，必須要有相關人員擔任總協調員（HACCP Coordinator）對可能的問題產品實施緊急召回，最大限度保護消費者的利益。

HACCP和ISO9000體系的區別：

ISO9000與HACCP都是一種預防性的質量保證體系。ISO9000適用于各種產業，而HACCP只應用于食品行業，強調保證食品的安全、衛生。
       

ISO9000與HACCP的區別：
      項目 ISO9000-------------------HACCP
     適用范圍 適用于各行各業----------------應用于食品行業
     目標 強調質量能滿足顧客要求---------------- 強調食品衛生，避免消費者受到危害
     標準
     企業可在ISO9001-9003三種模式中依自身條件選擇其一，再逐步提高作業標準----------------
     企業可依據市場所在國政府的法規或規范(如在國內銷售的產品，要依據我國頒布的《水產品加工質量管理規范》生產；出口到美國的產品，要依據其聯邦法規《水產品生產與進口的安全衛生程序》)的要求生產產品
    標準內容 標準內容涵蓋面廣，涉及設計、開發、生產、安裝和服務 內容較窄，以生產過程的控制為主
    監控對象 無特殊監控對象---------------- 有特殊監控對象，如病原菌
    實施 自愿性---------------- 由自愿逐步過渡到強制

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